Se trata del primer pueblo que fundó Carlos Casado, en 1873, cuyo nombre recordaba a una hija suya: Genara.
La aprobación de su trazado fue cumplimentada por decreto del 15 de octubre de 1891. El 31 de agosto de ese mismo año, se había procedido a creación de la comuna.	
La localidad de San Genaro es cabecera del distrito comunal de igual denominación cuya superficie comprende 79 kilómetros cuadrados.
La misma está situada sobre la ruta nacional número 65, dista 133 kilómetros al suroeste de la capital provincial y a dos de la RN N° 34, se halla en una región eminentemente agrícolo-ganadera, en la principal cuenca lechera de Iberoamérica.